Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt1P04104 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt1P04104 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt1P04104 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt1P04104 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt1P04104 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt1P04104 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt1P04104 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt1P04104 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt1P04104 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt1P04104 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt1P04104 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt1P04104 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt1P04104 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt1P04104 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt1P04104 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt1P04104 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt1P04104 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt1P04104 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt1P04104 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt1P04104 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt1P04104 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt1P04104 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt1P04104 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt1P04104 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt1P04104 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Krt1P04104 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms