Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lamc1P02468 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lamc1P02468 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lamc1P02468 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lamc1P02468 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lamc1P02468 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lamc1P02468 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Lamc1P02468 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lamc1P02468 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lamc1P02468 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lamc1P02468 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lamc1P02468 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lamc1P02468 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lamc1P02468 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lamc1P02468 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Lamc1P02468 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lamc1P02468 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lamc1P02468 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms