Protein–RNA interactions for Protein: P01680

Ig kappa chain V-IV region S107B, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01680 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01680 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01680 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01680 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01680 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01680 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01680 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01680 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01680 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01680 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01680 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01680 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01680 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01680 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01680 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01680 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01680 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01680 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01680 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01680 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01680 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01680 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01680 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01680 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01680 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01680 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01680 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01680 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01680 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01680 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01680 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01680 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01680 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01680 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01680 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01680 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01680 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01680 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01680 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01680 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01680 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01680 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01680 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01680 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01680 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01680 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01680 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01680 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01680 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01680 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01680 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01680 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01680 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01680 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01680 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01680 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01680 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01680 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01680 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01680 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01680 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01680 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01680 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01680 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01680 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01680 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01680 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01680 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01680 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01680 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01680 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01680 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01680 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01680 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01680 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01680 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01680 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01680 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01680 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01680 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01680 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01680 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01680 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01680 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01680 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01680 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01680 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01680 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01680 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01680 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01680 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01680 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01680 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01680 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01680 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01680 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01680 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01680 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01680 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01680 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms