Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01641 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01641 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01641 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01641 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01641 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01641 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01641 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01641 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01641 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
P01641 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01641 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01641 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01641 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01641 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01641 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01641 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01641 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01641 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
P01641 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01641 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01641 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01641 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01641 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01641 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01641 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01641 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01641 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01641 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01641 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01641 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01641 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01641 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01641 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01641 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01641 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
P01641 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01641 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01641 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01641 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01641 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01641 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01641 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01641 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01641 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01641 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01641 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01641 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01641 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01641 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01641 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01641 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01641 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01641 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
P01641 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01641 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01641 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01641 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01641 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01641 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01641 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01641 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
P01641 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01641 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01641 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01641 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01641 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01641 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01641 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01641 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01641 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01641 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01641 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01641 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01641 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01641 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01641 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01641 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01641 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01641 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01641 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01641 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01641 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01641 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
P01641 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
P01641 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
P01641 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
P01641 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01641 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01641 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01641 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
P01641 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
P01641 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01641 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01641 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01641 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01641 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01641 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01641 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01641 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 379.8 ms