Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lancl1O89112 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lancl1O89112 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms