Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sp1O89090 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Sp1O89090 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp1O89090 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp1O89090 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp1O89090 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp1O89090 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms