Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Robo1O89026 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Robo1O89026 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Robo1O89026 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Robo1O89026 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Robo1O89026 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Robo1O89026 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Robo1O89026 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms