Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apaf1O88879 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apaf1O88879 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms