Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnnt1O88346 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnt1O88346 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms