Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Itgb5O70309 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb5O70309 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb5O70309 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb5O70309 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb5O70309 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb5O70309 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb5O70309 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb5O70309 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb5O70309 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb5O70309 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb5O70309 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb5O70309 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb5O70309 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb5O70309 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb5O70309 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb5O70309 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Itgb5O70309 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb5O70309 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb5O70309 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb5O70309 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb5O70309 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb5O70309 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Itgb5O70309 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms