Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lnx1O70263 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lnx1O70263 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms