Protein–RNA interactions for Protein: O54908

Dkk1, Dickkopf-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk1O54908 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk1O54908 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms