Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TnxbO35452 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnxbO35452 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnxbO35452 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnxbO35452 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnxbO35452 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnxbO35452 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnxbO35452 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnxbO35452 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnxbO35452 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TnxbO35452 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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TnxbO35452 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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TnxbO35452 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TnxbO35452 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TnxbO35452 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TnxbO35452 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TnxbO35452 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TnxbO35452 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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