Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrt1O35449 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrt1O35449 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms