Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Xbp1O35426 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Xbp1O35426 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms