Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-ObO35424 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms