Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kpna3O35344 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kpna3O35344 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms