Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nedd9O35177 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Nedd9O35177 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Nedd9O35177 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nedd9O35177 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nedd9O35177 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nedd9O35177 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nedd9O35177 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nedd9O35177 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nedd9O35177 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Nedd9O35177 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nedd9O35177 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nedd9O35177 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nedd9O35177 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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