Protein–RNA interactions for Protein: O35137

Alx4, Homeobox protein aristaless-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx4O35137 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx4O35137 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx4O35137 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx4O35137 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Alx4O35137 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx4O35137 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx4O35137 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx4O35137 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx4O35137 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx4O35137 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx4O35137 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alx4O35137 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms