Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ClockO08785 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClockO08785 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClockO08785 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClockO08785 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClockO08785 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClockO08785 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClockO08785 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClockO08785 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ClockO08785 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ClockO08785 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClockO08785 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClockO08785 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClockO08785 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClockO08785 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClockO08785 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClockO08785 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClockO08785 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClockO08785 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClockO08785 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClockO08785 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClockO08785 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ClockO08785 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClockO08785 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClockO08785 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClockO08785 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClockO08785 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClockO08785 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClockO08785 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClockO08785 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClockO08785 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClockO08785 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClockO08785 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClockO08785 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClockO08785 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClockO08785 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClockO08785 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClockO08785 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClockO08785 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClockO08785 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ClockO08785 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClockO08785 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClockO08785 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ClockO08785 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ClockO08785 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClockO08785 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClockO08785 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ClockO08785 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClockO08785 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ClockO08785 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ClockO08785 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ClockO08785 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ClockO08785 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ClockO08785 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ClockO08785 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClockO08785 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClockO08785 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClockO08785 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClockO08785 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClockO08785 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClockO08785 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClockO08785 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClockO08785 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClockO08785 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClockO08785 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClockO08785 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClockO08785 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClockO08785 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClockO08785 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClockO08785 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClockO08785 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClockO08785 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ClockO08785 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClockO08785 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClockO08785 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClockO08785 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClockO08785 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClockO08785 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClockO08785 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClockO08785 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ClockO08785 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClockO08785 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClockO08785 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClockO08785 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClockO08785 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClockO08785 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClockO08785 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClockO08785 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClockO08785 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClockO08785 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClockO08785 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ClockO08785 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ClockO08785 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ClockO08785 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClockO08785 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClockO08785 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ClockO08785 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ClockO08785 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClockO08785 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClockO08785 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms