Protein–RNA interactions for Protein: O08542

Efna4, Ephrin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna4O08542 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna4O08542 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna4O08542 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna4O08542 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efna4O08542 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna4O08542 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna4O08542 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna4O08542 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna4O08542 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna4O08542 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efna4O08542 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms