Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20939L7N243 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20939L7N243 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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