Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm21900J3QP38 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm21900J3QP38 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm21900J3QP38 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm21900J3QP38 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm21900J3QP38 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm21900J3QP38 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm21900J3QP38 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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