Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3727J3QM54 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3727J3QM54 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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