Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm29394H3BIW7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm29394H3BIW7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms