Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tubgcp6G5E8P0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tubgcp6G5E8P0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tubgcp6G5E8P0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms