Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r12G5E8G1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms