Protein–RNA interactions for Protein: G5E870

Trip12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip12G5E870 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trip12G5E870 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip12G5E870 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms