Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf148G3X9R7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf148G3X9R7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms