Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
D430041D05RikF6ZGR6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
D430041D05RikF6ZGR6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms