Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Crocc2F6XLV1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC28.83■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Crocc2F6XLV1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Crocc2F6XLV1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms