Protein–RNA interactions for Protein: F6WIE4

Gm10563, Predicted gene 10563, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10563F6WIE4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm10563F6WIE4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm10563F6WIE4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms