Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Urb2E9Q7L1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Urb2E9Q7L1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Urb2E9Q7L1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms