Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc85cE9Q6B2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc85cE9Q6B2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms