Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BC005561E9Q5E2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BC005561E9Q5E2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BC005561E9Q5E2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms