Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hectd4E9Q2E4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hectd4E9Q2E4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hectd4E9Q2E4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hectd4E9Q2E4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms