Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Zfp558E9Q1J0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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Zfp558E9Q1J0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Zfp558E9Q1J0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Zfp558E9Q1J0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Zfp558E9Q1J0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Zfp558E9Q1J0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Zfp558E9Q1J0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Zfp558E9Q1J0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zfp558E9Q1J0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Zfp558E9Q1J0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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