Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Gm3893E9Q1I1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3893E9Q1I1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3893E9Q1I1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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