Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt78E9Q0F0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms