Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brd1E9PZ26 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brd1E9PZ26 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Brd1E9PZ26 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brd1E9PZ26 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brd1E9PZ26 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Brd1E9PZ26 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brd1E9PZ26 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brd1E9PZ26 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Brd1E9PZ26 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brd1E9PZ26 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brd1E9PZ26 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brd1E9PZ26 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brd1E9PZ26 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brd1E9PZ26 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brd1E9PZ26 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Brd1E9PZ26 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brd1E9PZ26 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Brd1E9PZ26 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brd1E9PZ26 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brd1E9PZ26 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brd1E9PZ26 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brd1E9PZ26 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brd1E9PZ26 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brd1E9PZ26 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brd1E9PZ26 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brd1E9PZ26 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Brd1E9PZ26 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Brd1E9PZ26 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Brd1E9PZ26 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Brd1E9PZ26 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Brd1E9PZ26 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms