Protein–RNA interactions for Protein: E9PY46

Ift140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift140E9PY46 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ift140E9PY46 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ift140E9PY46 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ift140E9PY46 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ift140E9PY46 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms