Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Srp54bE9PXC0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp54bE9PXC0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms