Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim30bE9PVL6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30bE9PVL6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30bE9PVL6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30bE9PVL6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30bE9PVL6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30bE9PVL6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30bE9PVL6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30bE9PVL6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30bE9PVL6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30bE9PVL6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30bE9PVL6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30bE9PVL6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim30bE9PVL6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30bE9PVL6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30bE9PVL6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30bE9PVL6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30bE9PVL6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30bE9PVL6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30bE9PVL6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30bE9PVL6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30bE9PVL6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30bE9PVL6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30bE9PVL6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30bE9PVL6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim30bE9PVL6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms