Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim5E9PV98 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim5E9PV98 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim5E9PV98 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim5E9PV98 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim5E9PV98 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim5E9PV98 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim5E9PV98 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim5E9PV98 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim5E9PV98 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim5E9PV98 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim5E9PV98 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim5E9PV98 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim5E9PV98 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim5E9PV98 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms