Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Soga1E1U8D0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Soga1E1U8D0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Soga1E1U8D0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms