Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Klhl3E0CZ16 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms