Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kif28pD3YXS5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif28pD3YXS5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms