Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rexo5D3YW29 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Rexo5D3YW29 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rexo5D3YW29 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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