Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmf1B9EKI3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmf1B9EKI3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms