Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Cttnbp2B9EJA2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Cttnbp2B9EJA2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cttnbp2B9EJA2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms